1.這禮拜王老師介紹的網站是RCSB protien data bank以及PyMol軟體的使用。
RCSB data bank可以幫助我們了解蛋白質的組成和立體結構。
2.在PDB statisitcs的統治資料中,可以看到目前已經有105025個protien被解出結構了!!!!!!不管是NMR或是X-ray等的方法都有統計數據。
3.在我的研究中,主要研究的是幽門桿菌H. pylori的碳源調節蛋白(Carbon storage regulatorA),因為在HP的文獻中還沒有被解出CsrA的結構報導,所以我找了E. coli的CsrA來看結構,目前E. coli於CsrA的研究也是最完整的。E.coli的結構代號是1Y00。
4.到PyMol的網站下載PyMol的軟體,並且輸入1Y00的代號就會跑出CsrA的結構。可以使用設定更改結構為卡通圖和換顏色,更好用的功能是可以輸入胺基酸序列找出在立體結構中相對影的位置。(P.S.動畫代補)






