STRING於蛋白質交互作用的預測

STRING 9.1是免費線上網站，主要功能是以Network來呈現protein-protein interaction，其網址為http://string-db.org/

Step1. 進入STRING頁面，在搜尋protein name打上有興趣的蛋白名稱，我搜尋的是跟我研究有相關的CsrA蛋白，Organism選擇Helicobacter pylori 26695。點選GO!就會開始run data。

Step2. 在protein-protein interaction network中可以清楚看到與CsrA蛋白有交互作用的其他protein 。在input的表格中有簡單列出Predicted functional partners以及基因之間相關的score 。

STRING對於預測protein & protien interaction是很有用的工具。